یک مدل بازی مشارکتی برای تحلیل داده های بیان ژنی آزمایش ریزآرایه

نویسندگان

یونس کردوندی

حمیدرضا نویدی

مجید حسن پور عزتی

چکیده

فناوری ریزآرایه یک ابزار تحلیلی کوچک است که به کمک آن می توان بیان ده ها هزار ژن را، به طور همزمان مورد کاوش قرار داد. سوال عمده مورد بحث در ریزآرایه ها، چگونگی انتخاب مارکرهای ژنی می باشد، تشخیص مارکرهای ژنی می تواند تشخیص زودتر، درمان و پیش بینی دقیق تر نتیجه بیماری ومتعاقب آن استفاده از درمان های مناسب وکاهش هزینه ها را در پی داشته باشد.با استفاده از نظریه های آماری برای پردازش داده های ریزآرایه، تنهاقادر به شناسایی تعداد معدودی از ژن های با نظم متفاوت در نمونه های تحت بررسی خواهیم بود. به منظور تقویت سیگنال های حاوی اطلاعات مفید بیولوژیکی، اخیراً محققان نظریه بازی توانسته اند روشی را ابداع نمایند که با به کارگیری آن روی داده های بیان ژنی آزمایش ریزآرایه، قادر خواهیم بود گروهی از ژن های با تاثیرگذاری مضاعف در بروز یک اختلال را شناسایی کنیم. در این روش، با استفاده از نظریه بازی های همکارانه، به مدل سازی سهم مشارکت هر یک از ژن های دخیل در بروز یک اختلال که بیان شان دچارتغییر شده است، پرداخته می شود. . در این تحقیق، مدل مذکور با ترکیب حلی مفهوم ارزش شیپلی از بازی های همکارانه با قابلیت انتقال سودمندی به همراه مفهوم بوت استرپ آماری، گزینشی از ژن های با تاثیرگذاری مضاعف در بروز یک اختلال مورد بررسی قرار گرفته است. در یک مطالعه موردی، این مدل سازی روی داده های به دست آمده از افراد مبتلا به بیماری اوتیسم اجرا شده است. نتایج به دست آمده از این پژوهش همخوانی بالایی با نتایج تحقیقات بیولوژیک از خود نشان می دهد.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

شبکه های بیان ژنی برای آنالیز داده ماکرواری DNA

بر خلاف دیدگاه تقلیل گرایانه بیولوژی کلاسیک ، رویکرد کل نگر در بیولوژی با انفجار در پیشرفت تکنیک هایی با تکنولوژی بالا و تولید حجم عظیم داده خود را نشان داده است . اکنون چالش بیولوژیست ها کشف روش های تحلیل این داده ها است تا بتوانند در رسیدن به درک سیستم پویای پیچیده حیات کمک کنند. در بین تکنولوژی های بسیار پیشرفته اخیر که بیشترعمومی هستند میکرواری DNA از مشهورترین آن ها است . میکرواری،سطوح بیا...

متن کامل

تحلیل خانواده‌های ژنی در ریزآرایه لنفوبلاستیک حاد

  سابقه و هدف: تحلیل خانواده ژنی داده‌های ریزآرایه، مسیرهای بیولوژیکی یا خانواده‌های ژنی که بین فنوتیپ‌های مورد نظر بیان متفاوتی دارند، را شناسایی می‌کند. بر خلاف تحلیل مبتنی بر ژن‌های منفرد، تحلیل خانواده‌های ژنی دانش بیولوژیکی موجود روی ژن‌ها را برای بررسی تفاوت بیان ژنی بین فنوتیپ‌ها به کار می‌گیرد. در این مطالعه به مقایسه دو روش تحلیل خانواده‌های ژنی پرداخته می‌شود. مواد و روش‌ها: از ...

متن کامل

شبکه های بیان ژنی برای آنالیز داده ماکرواری dna

بر خلاف دیدگاه تقلیل گرایانه بیولوژی کلاسیک ، رویکرد کل نگر در بیولوژی با انفجار در پیشرفت تکنیک هایی با تکنولوژی بالا و تولید حجم عظیم داده خود را نشان داده است . اکنون چالش بیولوژیست ها کشف روش های تحلیل این داده ها است تا بتوانند در رسیدن به درک سیستم پویای پیچیده حیات کمک کنند. در بین تکنولوژی های بسیار پیشرفته اخیر که بیشترعمومی هستند میکرواری dna از مشهورترین آن ها است . میکرواری،سطوح بیا...

متن کامل

تحلیل خانواده های ژنی در ریزآرایه لنفوبلاستیک حاد

سابقه و هدف: تحلیل خانواده ژنی داده های ریزآرایه، مسیرهای بیولوژیکی یا خانواده های ژنی که بین فنوتیپ های مورد نظر بیان متفاوتی دارند، را شناسایی می کند. بر خلاف تحلیل مبتنی بر ژن های منفرد، تحلیل خانواده های ژنی دانش بیولوژیکی موجود روی ژن ها را برای بررسی تفاوت بیان ژنی بین فنوتیپ ها به کار می گیرد. در این مطالعه به مقایسه دو روش تحلیل خانواده های ژنی پرداخته می شود. مواد و روش ها: از دو روش ط...

متن کامل

توسعه یک مدل تحلیل پوششی داده ها برای ارزیابی عملکرد تولید به همراه یک مطالعه موردی

در دنیای رقابتی امروز، سازمان ها دائماً در حال بررسی، ارزیابی و بازنگری عملکرد خود و رقیبان خود میباشند. با درک اجزای تشکیل دهنده عملکرد شرکت ها و شناسایی ناکارامدی های یک سیستم، سازمان می تواند جایگاه خود را در بازار ارتقاء دهد. تحلیل پوششی دادهها به عنوان رویکردی پذیرفته شده برای مقایسه و ارزیابی عملکرد کاربردهای گسترده ای یافته است. در این تحقیق از تحلیل پوششی دادهها برای ارزیابی عملکرد ماهان...

متن کامل

الگوریتم های خوشه بندی دوبعدی در داده های بیان ژنی: یک مطالعه مروری

در سال های اخیر تکنولوژی ریز آرایه امکان مشاهده و بررسی بیان هم زمان هزاران ژن را وقتی سلول تحت شرایط مختلف یا پروسه های متفاوت قرار می گیرد را فراهم کرده است و نقشی اساسی در سرعت بخشیدن و بالا رفتن کارایی مطالعات بیان ژنی ایفا می کند. یکی از مهم ترین تکنیک های تشخیص الگو در داده های بیان ژنی تحلیل خوشه بندی دوبعدی است که می تواند گروه هایی از ژن ها با الگو های بیان شده مشابه را بیابد. مطالعه ح...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
تحقیق در عملیات در کاربردهای آن

جلد ۱۰، شماره ۴، صفحات ۰-۰

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023